Marijampolės Palaimintojo Jono Pauliaus II bažnyčios kompleksas projektuojamas svarbiausių gatvių susikirtimo ašių centre, ant kalniuko. Kompleksas susideda iš bažnyčios, koplyčios, parapijos namų pastatų. Architektūra paprasta, tradicinių formų, „aprengta“ šiuolaikinių rūbu.